脑积水是由多种原因引起的，主要包括以下几方面：
先天畸形：如中脑导水管狭窄、膈膜形成或闭锁、室间孔闭锁畸形（第四脑室正中孔或侧空闭锁）、脑血管畸形、脊柱裂、小脑扁桃体下疝等导致脑脊液循环障碍。
感染：如感染性脑膜炎、脑炎、寄生虫病等；感染后增生的纤维组织阻塞了脑脊液的循环通路；炎症反应同时也可以使脑池、蛛网膜下腔和蛛网膜粒粘连闭塞，造成脑脊液循环和吸收障碍。
卒中：如脑出血、蛛网膜下腔出血、静脉窦血栓形成、脑梗死等；颅内出血后引起的纤维增生，产伤颅内出血吸收不良等。
其他疾病：如先天性水头症、脑炎、脑脊液吸收不良综合症、颅内静脉窦血栓等。
另外，临床上还经常可以遇到一些脑血管畸形的患者，尤其是颅内动脉瘤和血管畸形的患者，在疾病后期会出现脑积水的表现。这些患者往往是由于颅内动脉瘤或血管畸形破裂导致蛛网膜下腔出血，血液流入脑室系统，阻塞了脑室循环通路，导致脑积水。